Özel Yaşamı
Harris Kasım 2006 yılında gay olduğunu açıkladıktan hemen sonra Eylül 2007'de partneri David Burtka ile Emmy Ödülleri'ne katılmıştır. 2004 yılından beri süren ilişkilerini, 2011 yılında taşıyıcı bir anneden evlat edindikleri ikiz bebekleriyle süslemişlerdir. Bebekleri Gideon Scott ve Harper Grace Ekim 2010'da dünyaya gelmiştir.
Harris, canlandırdığı karakteri Barney Stinson gibi bir sihirbazlık hayranıdır ve hiç canı sıkılmaz.