Pera Palas'ta Gece Yarısı dizisinde Charles King'in "Midnight at the Pera Palace" adındaki ödüllü kitabından uyarlanan dram türündeki dizi, Esra adındaki genç bir gazetecinin İstanbul'daki efsanevi Pera Palas Oteli hakkında bir yazı yazması için görevlendirilmesinden sonra olan ilginç olayları konu alıyor. Esra tarihi Pera Palas Oteli ile ilgili yazısı için otele gider ve kaldığı odalardan birinin 1919 yılına açılan bir kapı olduğunu anlar. Bu harika keşfi sayesinde geçmişe bir yolculuk yapar. Bu sayede modern Türkiye'nin kurucusu Mustafa Kemal Atatürk'e karşı düzenlenen siyasi bir komplodan haberdar olur. Bundan sonra Esra, Türkiye'nin tarih akışını ve geleceğini korumak zorundadır ve kurnaz otel müdürü Ahmet ile birlikte hareket edecektir. Ancak Esra bu sırada Halit adında İstanbul'un en çılgın kulübünün sahibi, yakışıklı ve gizemli adamla tanıştıktan sonra, 1919 İstanbul'unda aslında hiçbir şeyin göründüğü gibi olmadığını anlar.